医院建于年，是上海医院。医院目前由东西南北四个院区和上海市肿瘤研究所组成，是一个学科门类齐全，集医疗、教学、科研于一体医院。
东院位于浦东陆家嘴金融贸易区内；西院位于黄浦区中央商务区内，毗邻外滩；南院位于闵行区浦江镇，紧邻世博家园；北院位于巨野路灵山路；肿瘤所位于斜土路，由癌基因与相关基因国家重点实验室、肿瘤流行病学研究室、十一个相关的研究课题组、辅助部门公共服务平台与《肿瘤》杂志编辑部组成，于年10月与医院“院所合一”。
医院东、西、北三个院区目前总核定床位张，南院核定床位张。截至年底，医院共有在编职工人（不含南院），其中正、副高级职称专家名；博导91名、硕导名。
医院设有55个临床医技科室：消化科、心内科、神经外科、风湿病科、核医学科、妇产科、妇科肿瘤科、泌尿科、肾脏科、麻醉科、疼痛科、重症医学科、放射科、胃肠外科、肝脏外科、胆胰外科、乳腺外科、血管外科、头颈外科、血液科、老年病科、超声医学科、神经内科、内分泌科、骨科、骨关节外科、脊柱外科、创伤骨科、呼吸科、耳鼻咽喉科、整形外科、眼科、生殖医学科、放射诊疗科、药剂科、健康保健中心、输血科、检验科、儿科、康复科、口腔科、皮肤科、肿瘤科、急诊科、胸外科、心血管外科、病理科、中医科、营养科、内科门诊、感染科、肿瘤介入科、功能神经外科、变态反应科（过敏科）、心理医学科等。
近年来，医院申请到的科研项目及专利逐年递增，包括国家级的计划、计划、国家自然基金（重大、重点、创新研究群体）项目等，其中年科研经费达1.06亿元。
医院还获得多项国家科技进步奖、中华医学科技奖、高等学校科技进步奖等；先后共有几百人次入围各级人才培养计划，包括首席科学家、长江特聘教授、卫生部有突出贡献中青年专家、国家杰出青年、上海市领军人才等。医院与美国、加拿大、法国、比利时、德国、澳大利亚等近十个国家的二十多所医学院校建立了学术交流和友好合作关系。
风湿病科医院风湿免疫科创立于年，独立拥有临床、研究所等，配置完善，整体实力强，医疗技术水平高，医疗安全保障好。
学科在系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、抗磷脂抗体综合征、炎性肌病、白塞病、成人斯蒂尔病、强直性脊柱炎等风湿性疾病的流行病学、发病机理、诊治策略等方面进行了30多年的持续探索，使得风湿性疾病患者的生存率大大提高，死亡率明显下降，生活质量有了极大的提高。其中以系统性红斑狼疮为代表的系统性自身免疫性疾病的诊治水平处于国内外领先水平。
医院风湿免疫科是上海市风湿病学临床医学中心，上海市教委特色学科，上海交通大学重点学科，是风湿病学专业首批硕士和博士授予点单位及博士后流动站，上海市内科住院医师和风湿病专科医师规范化培训基地，拥有上海市风湿病学研究所，上海市临床检验质量控制中心自身免疫风湿性疾病参比实验室，和国家药品临床研究基地（风湿和免疫专业）。在年度中国最佳专科排名中，医院风湿科位列全国第二，并于今年入选国家临床重点专科建设项目。
医院风湿科在风湿病及自身免疫病领域实力雄厚、成就斐然，是一个在国内外享有盛誉的风湿病临床诊治及研究中心。
目前拥有正式床位张，在华东地区具有较强的辐射力，接收上海市内、医院转出的各种疑难及重症风湿性疾病患者，也承担了华东医院的风湿病疑难会诊，出色完成了大量难治性风湿病的诊治工作。
医院风湿科目前门诊量超过15万人次/年，吸引了大量外地病人；近5年来专科门诊就诊人数以每年10％－20％速度递增，年门诊人数达到15万8千人次，其中55.7％来自外省市，部分来自国外，包括印度尼西亚、新加坡、日本和美国，并以疑难、危重病例居多，在国内外同行及广大病人中有良好的口碑。
